Porfirio Díaz fue quién personalmente se encargó de sus planos, por medio de un catálogo a una compañía Inglesa iniciando su construcción en el año de 1898, siendo inaugurado el 16 de Octubre de 1902 por el mismo Don Porfirio Díaz.   
Este Edificio se levantó entre los Ríos Pánuco y Tamesí.

El Edificio es de estilo inglés, construido con elementos prefabricados de tabique rojo y hierro fundido, los elementos de herrería de este edificio fueron importados de Francia, los elementos de madera como puertas, ventanas, fueron importadas de Lousiana, Estados Unidos.
 

De acuerdo con la reforma administrativa, la Aduana ha simplificado al máximo sus trámites, impulsando una mayor fluidez en el tráfico de mercancías y aumentando los volúmenes de las mismas, de manera de la recaudación fiscal se ha incrementado en los últimos años.

En este aspecto desempeñan un papel muy importante las 26 agencias aduanales que representan formalmente a importadores y exportadores, al realizar una función tan delicada como la de clasificar las mercancías para calcular el monto de los derechos y responsabilizarse solidariamente con sus clientes.