La HTA supone una mayor resistencia para el músculo cardiaco, de modo que el corazón está obligado a aumentar su masa muscular (hipertrofia) para hacer frente a ese sobreesfuerzo. En una primera fase, el crecimiento de la masa muscular es beneficioso pero, con el tiempo, acaba siendo perjudicial ya que la mayor masa muscular no se acompaña de un aumento equivalente del riego sanguíneo, lo que puede producir insuficiencia coronaria y angina de pecho. Además, el aumento excesivo de la masa muscular vuelve al músculo cardiaco más irritable y son más frecuentes las arritmias. Tanto la insuficiencia coronaria como las arritmias o el aumento excesivo de masa muscular pueden hacer fracasar la función de la bomba del corazón y entonces ya estaríamos hablando de insuficiencia cardiaca.

La hipertensión arterial afecta también a las arterias ya que acaba por dañar las estructuras básicas. Esto facilita el desarrollo de la arterioesclerosis y de la trombosis oclusiva. En el peor de los casos la hipertensión arterial puede provocar el desarrollo de reblandecimientos de las paredes de la aorta (aneurisma) que pueden llegar a romperse bruscamente y producir la muerte.

También en el cerebro pueden aparecer complicaciones motivadas por la hipertensión arterial; una de ellas es el infarto cerebral, cuando las arterias se vuelven rígidas y estrechas, el riego sanguíneo de las zonas que de ellas dependen resulta insuficiente o cuando un trombo se desprende de una arteria de gran calibre y obstruye una arteria de diámetro inferior. Además, la hipertensión arterial puede provocar una hemorragia cerebral (cuando las arterias están lesionadas y acaban rompiéndose).

Asimismo la HTA puede producir asimismo alteraciones en los riñones ya que estos dependen de la lesión de los vasos que llegan a los riñones; la falta de riego conduce a la insuficiencia renal.